『壹』 什么是Genbank,它的主要用途是什么
GenBank序列数据库GenBank是美国国立卫生研究院(NIH)维护的基因序列数据库，汇集并注释了所有公开的核酸以及蛋白质序列。每个纪录代表了一个单独的、连续的、带有注释的DNA或RNA片段。目前GenBank中所有的纪录均来自于最初作者向DNA数据库的直接提交。蛋白质数据库：60年代初，Dayhoff和他的同事们收集了所有当时已知的氨基酸序列，这就是《蛋白质序列与结构图册》。这一蛋白质数据库后来成为蛋白质信息资源PIR。核苷酸数据库：1982年在欧洲分子生物学实验室(EMBL)诞生，随即就开始了一个数据库爆炸的时代。后来NIH搞了GenBank。日本的DNA数据库(DDBJ)加入了数据收集的合作。国际DNA序列数据库合作计划。规定了数据记录和更新的规则。国际核苷酸序列数据库合作成员GenBank–DDBJ–EMBL。GenBank指的是DDBJ/EMBL/GenBank开发利用这些信息的工具（如NCBI的信息检索系统 Entrez http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Entrez/）编码序列(CDS)：大多数蛋白质序列都不是直接由实验确定的，而是通过DNA序列得到的。这种方法需要进行大量的实验、计算以及相似性比对工作。他也赋予一个产物名称，或者功能说明(通过主观的对相似性比对的分析)。数据库的格式与内容：数据库被用来存放原始数据和一系列附加的信息。不同的检索工具和程序利用了这些信息中的不同部分。FASTA 格式：广泛应用于许多分子生物学软件包之中。作为最简单的情况，大于号(>)表示一个新文件的开始。通常60个字符一行。>gb|AF150991|AF150991 Trichoplusia ni single capsid nuclear polyhedrosis virus.ensures greater occlusion body stabilityproct–p10 / p10 protein>gb|AF275264|AF275264 Helicoverpa zea nuclear polyhedrosis virus.complementproct–e66-like protein (partial DNA sequence)>gb|AF275264|AF275264 Helicoverpa zea nuclear polyhedrosis virus.complementproct–p13>gb|AF275264|AF275264 Helicoverpa zea nuclear polyhedrosis virus.proct–Orf50-like proteinASN.1Genbank flatfile:头部：始于LOCUS行—LOCUS名称，序列长度，生物分子的类型(ss或ds DNA,RNA,tRNA,rRNA, mRNA)，GenBank分类码，数据公开日期DEFINITION行—总结纪录的生物意义。检索号—是从数据库中检索一个记录的主要关键词。格式：1+5或2+6。所有的GenBank记录都只有一个单独的ACCESSION行。NID—行表示核苷酸序列的gi号码(geninfo identifier)。一个gi号码对应于一个核苷酸序列。当序列改变时，gi号也改变，但检索号不变。KEYWORDS—SOURCS—ORGANISM—REFERENCE—AUTHORS—TITLE—JOURNAL—
